还有一些问题会给电子标签的读取造成困难，比如说，标签发送信号的速度不够快，当读取器同时读取多个标签时可能造成混淆。此外，金属会反射无线电波，而液体又会吸收无线电波，因此当包装箱内装有金属或液体时，都会给电子标签的识别造成困难。针对这个问题，联邦快递公司的创新和扫描技术主管米利·安斯沃斯（Miley Ainsworth）提出了一套所谓“小心存放运输”（Place-very-carefully-and-ship）的解决方案，就是在纸箱的外面附加一个气袋（Air Pocket），将电子标签置于气带中，但这套方案太费时费力了。

　　大多数情况下，每500只电子标签中，就有100只会因为RFID包装标签中的内置天线失效或损坏而无法读取。“这些问题影响了电子标签读取器的可靠性。”RFID读取器生产商ThingMagic公司副总裁凯文·阿什顿（Kevin Ashton）抱怨道。不过读取器有时也会发生问题。如果两个或多个读取器挨得比较近的话，信号就会彼此干扰。

　　一些RFID芯片制造商正致力于提高芯片质量，而很多公司也在继续寻找标签、标签打印设备和读取器的非常好的组合。太平洋自行车公司自2003 年以来在RFID项目上已投资了近100万美元，并形成了3套读取器、标签和打印设备的组合。但根据公司信息系统总监马修的说法，目前读取率最好的组合也只能正确识读出70%~80%的货箱。基于第二代高频标准的电子标签的传输速度可达640K，理论上有助于提高读取率，但未来3~6个月内，这个产品还不会投放市场。

　　不过，在标准制订问题上倒是有好消息传来。2004年12月，EPCglobal就通过了第二代电子标签标准，并于2005年9月向一些读取器和芯片生产商发放了二代标准的兼容证书，这些厂商包括爱伦科技公司（Alien Technology）、实用无线设备公司（Applied Wireless Devices）、Impinj公司、易腾迈科技公司（Intermec Technologies）、MaxID Group、讯宝科技公司（Symbol Technologies）和ThingMagic公司。EPCglobal还加入到了RFID相关标准的激烈争夺中，比如关于哪些知识产权使用费应该免除的谈判。

　　情况正在缓和。2004年，EPCglobal内部的执行小组已着手制订读取器管理、读取协议和标签信息转换方面的标准。2006年， EPCglobal将推出50多项商业流程方面的具体规范，以期简化交易流程。2005年9月，该机构公布了第一套软件标准，即应用级事件（Application Level Events）标准。该标准规定了原始数据的收集、筛选、传输以及按照固定格式转换的具体流程，这一格式能使信息在EPC信息服务网络（EPC Information Services network）中被多方共享。EPCglobal美国公司总裁迈克·梅兰达（Mike Meranda）许诺，更多的商家将通过该网络得到“准确并可共享的数据”。